يُعدّ التخلص الفيزيائي من الرغوة أحد الأساليب الشائعة. على سبيل المثال، إبطاء معدل التحريك ميكانيكيًا، أو تحسين تصميم معدات الاستخلاص لتقليل الاضطراب الموضعي، وبالتالي تقليل اختلاط الغازات. إضافةً إلى ذلك، يُمكن لتسخين المستخلص أن يُقلل من توتره السطحي ويُسرّع من تمزق الرغوة. أما التخلص من الرغوة بالتفريغ فيستخدم بيئة ضغط منخفض لتشجيع الفقاعات على الخروج، مما يُقلل من تراكم الرغوة.

يمكن لطريقة إزالة الرغوة الكيميائية أن تُدمر بسرعة البنية المستقرة للرغوة. وتُعد إضافة الكمية المناسبة من مزيل الرغوة الغذائي أو الصيدلاني (مثل زيوت السيليكون، أو البولي إيثرات، أو الزيوت النباتية) إلى عملية الاستخلاص طريقة مباشرة وفعالة. في الوقت نفسه، من خلال ضبط درجة حموضة المستخلص، يمكن تثبيط قدرة بعض المواد الفعالة على تكوين الرغوة، مثل إنتاج الصابونين في بيئة متعادلة أو حمضية ذات قدرة ضعيفة على تكوين الرغوة.

تُعدّ طريقة إزالة الرغوة البيولوجية أنسب للعمليات التي تتطلب معايير دقيقة لتركيب المستخلص. إذ يُمكن لإضافة إنزيمات مُحددة (مثل البروتياز والسليولاز) أن تُحلل البروتينات أو السكريات المُسببة للرغوة، مما يُقلل من تكوّنها من المصدر. إضافةً إلى ذلك، يُمكن الحدّ من تكوّن الرغوة من خلال اختيار سلالات بكتيرية مُعينة والتحكم في عمليات الأيض أثناء التخمر الميكروبي.